Miejsce i mechanizm działania leptyny w postaci gryzoni wrodzonej lipodystrofii czesc 4

Ekspresję tych genów znormalizowano do poziomów WT po leczeniu leptyną. Kilka innych genów było podobnie regulowanych przez leptynę zarówno obwodową, jak i obwodową, przy czym większość genów była silniej regulowana przez icv niż poprzez leptynę obwodową (patrz Tabele dodatkowe i 2, http://www.jci.org/cgi/content/full/113 / 3/414 / DC1). Ponadto wiele genów, które zostały zmienione między wątrobami lipodystroficznymi i WT, również ulegało różnej ekspresji w wątrobach myszy ob / ob w porównaniu z myszami WT, co wskazuje, że zmiany w ekspresji genów wątroby u myszy P2-nSREBP-1c przypominają te u wrodzonych leptyn. niedobór (19). Tabela Porównanie ekspresji genów regulowanych przez icv w porównaniu z podskórną leptyną w wątrobie myszy transgenicznych a2-nSREBP-1c Globalne profile ekspresji genów w wątrobach myszy leczonych icv i podskórną leptyną są istotnie skorelowane. Aby rozszerzyć analizę ekspresji genów poza porównanie kilku kluczowych genów, wykorzystaliśmy standardowe hierarchiczne grupowanie do oceny podobieństwa leczenia centralnego i obwodowego leptyny (rysunek 3a). W powstałym dendrogramie profile transkrypcyjne w wątrobie po traktowaniu podskórnym i wapniem leptyny skupiają się razem, wskazując, że wzór ekspresji genu dla leczenia leptyną był bardziej podobny do dawki 200 ng / h obwodowego leczenia leptyną niż do innych testowanych. Figura 3Computacyjne analizy profilu transkrypcji w wątrobie po leczeniu icv i podskórnym leptyną. Przedstawiono analizę skupień, analizę korelacji i rozkład korelacji ekspresji genu wątrobowego z myszy leczonych za pomocą leptyny icv w porównaniu do PBS i podskórnej leptyny względem podskórnej PBS. (a) Standardowe hierarchiczne grupowanie 30 eksperymentów na mikromacierzach, w tym traktowanie leptyną i podskórną leptyną, pokazuje, że profile transkrypcyjne dla icv i podskórnej leptyny są bardziej podobne do siebie niż do jakiejkolwiek innej próbki. (b) Porównanie genów icv i podskórnej ekspresji genów leptyny pokazano dla genów regulowanych przez obie terapie (zbiór skrzyżowań). W pierwszym kwadrancie ekspresja genu jest zwiększona w leczeniu podskórnym i zmniejsza się w leczeniu icv; w drugim kwadrancie ekspresja genu wzrasta w obu terapiach; w trzecim kwadrancie ekspresja genu zmniejsza się w obu terapiach; aw czwartym kwadrancie ekspresja genu jest zmniejszona w leczeniu podskórnym i zwiększona w leczeniu icv. Niemal we wszystkich przypadkach ekspresja genów jest podobnie regulowana przez obie metody leczenia. . oznacza wartość korelacji. (c) Pokazano logarytm krotności zmian podskórnej leptyny względem PBS i leptyny icv względem PBS dla genów regulowanych przez traktowanie (zestaw związków). (d) Przedstawiono rozkład korelacji z 3962 porównań par z naszej bazy danych. Strzałka pokazuje korelację między obecnością leptyny we krwi w porównaniu do leczenia PBS a podaniem leptyny podskórnej w porównaniu do leczenia PBS. To pokazuje, że ekspresja genów po icv i podskórnej leptynie jest silniej skorelowana niż w przypadku innych porównań (P <0,002). Aby dostarczyć bardziej rzetelnych informacji ilościowych na temat znaczenia podobieństw, opracowaliśmy nowe podejście do określania znaczenia podobieństwa (korelacji) między profilami transkrypcyjnymi w wątrobie po podaniu ICV i podskórnej leptyny. Porównaliśmy globalne profile ekspresji genów ICV i podskórnej terapii leptyną przy użyciu dwóch metod: (i) analizy korelacji między genami, które są podobnie regulowane w obu eksperymentach, w tak zwanym zestawie skrzyżowań oraz (ii) analiza korelacji między geny regulowane w jednym lub w obu eksperymentach, w tak zwanym zestawie związków (patrz Dodatkowa uwaga w celu uzyskania bardziej szczegółowego opisu tej metody; http://www.jci.org/cgi/content/full/113 / 3/414 / DC1). Regresja liniowa logarytmów fałdowych zmian w zestawie przecięć wykazała nachylenie 0,6 obwodowej leptyny względem leptyny icv i współczynnik korelacji wynoszący 0,897 (Figura 3b). Nachylenie 0,6 wskazuje, że ogólnie leczenie leptyną miało większy wpływ niż podskórne podanie leptyny (patrz uwaga dodatkowa 2). W tej analizie, w zestawie związków korelacja między icv a podskórną leptyną wynosiła 0,738 (Figura 3b), z wyliczoną wartością P wynoszącą około 0,0014. Korelacja ta była jedną z najwyższych korelacji obserwowanych wśród 3 692 par badanych próbek, co wskazuje, że reakcje transkrypcyjne na icv i podskórną leptynę są bardzo podobne (rysunek 3d) (patrz uwaga dodatkowa 3). Profile transkrypcyjne w mięśniach szkieletowych [patrz też: techniki mma, najlepsza odzywka do rzes, centermed słoneczna tarnów ] [podobne: masaż nuru na czym polega, nr na pogotowie ratunkowe, ciasto z truskawkami moje wypieki ]